Expériences en laboratoire

Assistant Ingénieur de laboratoire

Institut de la Vision Paris, FR Depuis novembre 2025

Exploitation et amélioration de la plateforme MACSima pour l'immunofluorescence multiplexe à haut contenu. Standardisation des SOP, contrôle qualité et gestion de gros volumes de données (multi-To). Intégration avec l'imagerie 3D et, lorsque pertinent, la transcriptomique spatiale.

• Opération sur MACSima ; contrôle réactifs/anticorps
• Conception/optimisation de panels d'anticorps pour le multiplexe
• Pipeline 3D : acquisition, stitching, registration, correction de fond
• SOP et traçabilité expérimentale
• Analyse & QC d'images (ImageJ/Fiji, Python)

Projet Advanced Spatial Omics Pipeline — github.com/mathisbouvet

Stagiaire Biologie de la Reproduction

Institut de la Vision Paris, FR Janv. 2025 – Juin 2025

Développement de la technologie MACSima et intégration avec l'immunofluorescence 3D et la transcriptomique spatiale. Application sur la région lombo-sacrée d'un embryon humain (PCW8). Participation à l'analyse, l'interprétation et la rédaction des résultats.

• Analyses morpho-fonctionnelles en reproduction
• Programmation Python pour analyse d'images
• Immunofluorescence 3D, clearing, multiplexe
• Création d'un script d'évaluation et d'amélioration de la qualité des segments cellulaires (MACSima)

Données non publiées — résumé du projet ici

Stagiaire CECOS

Hôpital Tenon Paris, FR Mai 2024 – Juin 2024

Analyse biostatistique de la cohorte ALIFERT pour évaluer l'impact de l'activité physique sur l'infertilité masculine et féminine. Préparation des données, analyses et discussion des corrélations cliniques.

• Nettoyage et structuration des données (ALIFERT)
• Analyses : régressions, tests paramétriques/non paramétriques
• Visualisation & reporting (R/Python)
• Rédaction de notes de méthodes et synthèses

Données disponibles sur APFert