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Je travaille à l'interface entre biologie du développement et analyse de données. J'étudie les mécanismes cellulaires à partir d'imagerie multiplexe, en combinant travail expérimental et développement de pipelines d'analyse pour produire des cartographies précises.
Mes derniers travaux de recherche ↗Mis à jour le 1 juin 2026
Mise à jour
Dernière publication
Contrôle qualité de la segmentation
Advanced Spatial-Omics Pipeline · GitHub
Pipeline Python de validation de la segmentation cellulaire automatique : test de Kolmogorov–Smirnov, Isolation Forest et recommandations de paramètres via Mann–Whitney U.
Dernier projet
Déploiement du MACSima
Cartographie moléculaire · Institut de la Vision
Découvrez le parcours professionnel de Mathis Bouvet, Ingénieur de laboratoire à l'Institut de la Vision (Paris). Spécialisé en biologie de la reproduction humaine et en embryologie, il expertise le déploiement de la technologie MACSima (Miltenyi Biotec) pour l'immunofluorescence multiplexe à haut contenu.
Expertise technique : Imagerie 3D, microscopie confocale, transcriptomique spatiale (Spatial-Omics) et analyse d'images via Python et ImageJ/Fiji. Diplômé d'un Master en Biologie de la Reproduction de l'Université de Tours, son travail porte sur la cartographie moléculaire de l'embryon humain au sein du projet HuDeCa (Human Developmental Cell Atlas).
Ancien stagiaire au CECOS de l'Hôpital Tenon, il maîtrise les analyses biostatistiques liées à la fertilité et à la PMA. Retrouvez ses projets de programmation bioinformatique sur GitHub et son actualité scientifique sur LinkedIn.